(1)颅底长度(矢状位)缩短 很多研究表明阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者颅底长度较正常人明显缩短.Tang-Worn发现阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者S-N表现有轻度逆时针方向旋转:在同时有上下颌缩领畸形时这种变化更为明显。这些结构变化使面部在矢状方向上趋于狭窄，可能导致了骨性咽腔缩小。
(2)上下颌骨的大小和位置异常在颌面结构分析应用之前人们就注意到部分阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者下颌偏小、倾向于后缩。侧位片图像分析证实了上、下颌长度在部分阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者中较正常人为短，SNA,SNB角度缩小，提示上下颌骨后缩。Hochban等还发现阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者颅底至上颌骨背、腹侧矢状位距离缩短 ; Tangngsom对上下颌角度的研究提示，阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者不仅缩颌，还存在下颌平面角较大(MIJNSL角增大).这些变化可能间接导致了舌根部气道狭窄。
在先天性下颌萎缩和婴儿获得性小颌面畸形亦可导致阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征，少数类风湿性关节炎颞下颌关节破坏继发缩颌者发生阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征也见于报道，这些均提示颌面骨大小、位置变化与阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征有密切关系。
(3)舌骨移位舌骨为舌肌的主要附着结构，在生长发育过程中逐渐下降，成人一般定位于第4颈椎水平。它的位置与舌的大小、形态、位置互相影响。舌骨位置一向被认为在阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征诊断中具有重要价值.自Riley首先报道仪认卜污患者MP-H增大后，关干舌骨位置的研究几乎均发现, 阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者舌骨较正常人明显下前移位。舌骨移位可能舌体下移，充盈于上气道与舌骨之间的结果: 阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者多肥胖，颈粗短，相当量的脂肪组织积聚于颌下、下颌下、咽区，舌骨下移也被认为可能是气道狭窄后为降低气道阻力发生的代偿机制。国内的刘月华1991年的研究也得出相似的结论。