雾化治疗的危险或并发症主要包括:感染、支气管收缩、过度湿化、气道阻塞。
(一)感染
气溶胶颗粒可能携带病原微生物，污染雾化器、患者和参与治疗的医护人员。应定期消毒雾化器，避免污染和交叉感染。美国疾病预防控制中心(CDC)的指南推荐:湿化器和雾化器内应充注无菌溶液，每24小时更换1次。
(二)支气管收缩
某些气道反应性疾病患者(如哮喘)，在接受雾化治疗时可能出现支气管收缩，导致气道阻力增高，呼吸作功增加。这种情况在吸人冷雾时更为多见。此外，雾化吸人痰液溶解剂时也可能诱发支气管痉挛。雾化治疗前适当给予支气管扩张剂可避免支气管收缩的发生。
(三)过度湿化
长时间持续雾化吸人(如大于72小时)可能导致过度湿化，增加患者的体液负荷，这在儿科患者尤为明显。大量吸人含盐溶液还可能导致高钠血症，应注意监测。
(四)气道阴塞
对咳痰无力或咳嗽反射降低的患者实施雾化治疗，可能导致部分或完全气道阻塞。对这类患者应注意及时清理呼吸道。